聯邦臨床部（原醫學部）成立於1996年，是公司研發體系的重要組成部分，主要負責公司所有臨床試驗項目的方案設計、組織、實施、質量管理及相關工作。
　　經過多年的建設和發展，現部門職能明確、架構合理、管理規範。部門成員全部本科以上學歷，均為醫學、藥學及相關專業。
　　部門自成立至今，與國內100多家具有國家藥物臨床試驗資格且在相關治療領域權威的機構，如：北京協和醫院、中國人民解放軍總院（301醫院）、北京天壇醫院、北京友誼醫院、復旦大學附屬華山醫院、上海瑞金醫院、上海長征醫院、四川大學華西醫院、中國人民解放軍第四軍醫大學西京醫院和中山大學附屬第三醫院等緊密合作，在享譽國內外的知名專家的指導下共同組織完成了70多項藥物臨床試驗。
　　2006年∼2008年期間，分別由北京軍區總醫院、四川大學華西醫院、中國人民解放軍總醫院和安徽醫科大學附屬第一醫院牽頭組織，國內20多家知名的內分泌科室和幾十位專家參與，先後完成了人胰島素系列品種優思靈RN、優思靈RR、優思靈R30R和優思靈R50R四個品種的臨床試驗，試驗結果顯示均與原研對照藥具有相同的有效性和安全性，並於2011年1月成功召開了這四個品種的全國上市推廣會。
　　2011年∼2013年期間，由四川大學華西醫院牽頭組織，另有國內19家知名的三甲醫院內分泌科室參與，共同完成了通過應用DNA基因重組技術自主研發的人胰島素類似物--甘精胰島素的Ⅲ期臨床試驗。該項目在國家食品藥品監督管理總局2015年7月發佈的《關於開展藥物臨床試驗數據自查核查工作的公告》名單中，屬於第一批經過國內嚴格的藥物臨床試驗數據現場核查及評審之後終獲生產批件的項目，並於2017年5月在中華糖尿病雜誌社主辦的「基礎胰島素臨床應用高峰論壇」上召開了國產甘精胰島素注射液——聯邦優樂靈RUSLENR的上市啟動會。
　　2016年3月，國務院辦公廳印發《關於開展仿製藥質量和療效一致性評價的意見》國辦發〔2016〕8號文。聯邦製藥積極響應，不斷推進仿製藥一致性評價工作。2018年4月，聯邦製藥成為首家阿莫西林膠囊（0.25g）通過仿製藥質量和療效一致性評價的企業。
　　已完成的臨床試驗工作如下：
    1、各類化學藥品（大部分為原2類、3類）新藥品種臨床試驗共計22項；
    2、生物製品臨床試驗7項；
    3、中藥品種臨床試驗（包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期）1項；
    4、人體生物利用度和生物等效性試驗39項；
    5、藥物一致性評價生物等效性試驗2項。            
　　目前正在進行的臨床試驗共有4項，另有幾個化藥及治療用生物製品品種的臨床試驗項目即將啟動。          
　　聯邦製藥臨床部將繼續秉承「嚴謹、求實、勤奮、高效」的科研精神，繼續與國內知名的臨床試驗機構和專家合作，創新進取，共同實現聯邦製藥「讓生命更有價值」的企業理念。